好不容易拿到了自己的空間轉錄組數(shù)據(jù)，心情激動、躍躍欲試，想趕快去實施一下自己的idea，可是又不會寫代碼，只能干等著？當然不是，其實你完全可以實現(xiàn)不寫代碼完成自己大部分數(shù)據(jù)挖掘的工作。

在胚胎發(fā)育過程中，造血干細胞（HSCs）需要迅速分化為成熟的血細胞。當前主要通過小鼠和體外模型系統(tǒng)來了解胎兒造血干/祖細胞（HSPCs）。研究表明在發(fā)育過程中，胎兒的造血功能包括不同器官中稀有造血干細胞的分化、遷移。人類確定性造血作用始于背主動脈造血簇中HSCs的出現(xiàn)，這些HSCs在4 PCW首先定位于胎兒肝臟并進行擴張，在10.5 PCW時，造血部位轉移至骨髓并建立成人造血功能。

扎根于細胞生物學領域40余年，BD公司在流式和抗體領域占據(jù)著主導地位。作為目前單細胞研究常用的技術之一，BD公司2018年推出的Rhapsody?單細胞分析平臺克服了傳統(tǒng)檢測的局限性，能夠?qū)ι先f個單細胞的數(shù)千個表達基因同時進行定量檢測，鑒定和表征新型和罕見細胞類型，有助于理解從免疫學到腫瘤學等多個領域的生物學過程。

盡管轉錄組研究已經(jīng)獲得很多令人激動的進展，但它終歸還是一個高度協(xié)調(diào)的、受表觀基因組調(diào)控的基因表達程序的副產(chǎn)物。

研究人員使用空間轉錄組測序技術(spatial transcriptome，ST)來識別,阻斷腫瘤異質(zhì)性的來源，提供識別新的生物標志物的能力，并深入了解腫瘤細胞、脂肪組織、血管、三級淋巴結構和TME間基質(zhì)之間的動態(tài)相互作用。

過往研究報道了早期胎兒腸上皮細胞動力學與IBD之間的聯(lián)系，提示IBD患者的腸上皮中可能重現(xiàn)了類似于胎兒的轉錄程序。因此，解讀腸道發(fā)育是預防和治療此類疾病的關鍵一步。

DNA甲基化標志物作為標志物的成功案例有MGMT啟動子甲基化可預測膠質(zhì)母細胞瘤和血漿中甲基化SEPTIN 9(SEPT9)檢測無癥狀結直腸癌，這些都已被納入臨床指南并轉化為商業(yè)化臨床試驗。

識別人體器官細胞的特征及其相互作用對研究與疾病相關的生物學機制具有重要意義。

擬時序分析（pseudo-time），它指通過構建細胞間的變化軌跡來重塑細胞隨著時間的變化過程。用于擬時序分析的軟件和算法很多，目前文章中用到多的是Monocle軟件，這也是是CNS主流期刊的常用軟件。

微生物組與代謝組的數(shù)據(jù)整合方法按照是否基于已有知識可以分為統(tǒng)計學檢驗方法和知識驅(qū)動的整合分析方法。