935K 甲基化芯片（Infinium Methylation EPIC v2.0 BeadChip）是一種全基因組甲基化篩選工具，靶向人類甲基化組最具生物學(xué)意義的區(qū)域中超過 935,000 個 CpG 位點，同時在其前代產(chǎn)品 Methylation EPIC v1.0（850K）的基礎(chǔ)上極大的提高了向后兼容性。該芯片保留了以單核苷酸分辨率定量分析全基因組 CpG 的能力，同時提供高度準(zhǔn)確和精確的甲基化測量，不受測序深度的影響?？墒褂镁啞⒂脩粲押玫?Infinium 甲基化檢測分析多種 DNA 樣本類型，包括從 FFPE 分離的 DNA 樣本。與其他方法相比，Methylation EPIC v2.0 具有可擴(kuò)展性和更低的單個樣本總成本，因此可用于探究疾病機(jī)制和生物標(biāo)志物的篩選。
活動福利
項目周期： 自 DNA 質(zhì)控合格后標(biāo)準(zhǔn)生信分析結(jié)果發(fā)送 10 個工作日；
交付結(jié)果： 標(biāo)準(zhǔn)生信分析報告和原始數(shù)據(jù)；
DNA 要求： 常規(guī) DNA 總量≥1ug，濃度≥50ng/μl，OD260/280 在 1.8 左右；不得有其它個體或其它物種的 DNA 或 RNA 污染；溶解在 H20 或 TE (pH 8.0)，特殊樣本視具體情況實驗。
活動時間：2024 年 2 月 18 日至 2024 年 5 月 31 日
活動說明：
1、合同雙方簽訂完成時間必須在活動時間內(nèi)；
2、單次送樣數(shù)目為 8 的倍數(shù)；
3、活動最終解釋權(quán)歸伯豪生物所有。
935K 芯片優(yōu)勢
935K 與 850K 芯片數(shù)據(jù)相關(guān)性
935K 甲基化芯片檢測能夠檢測到 0.2 的 beta 值差異，假陽性率低于 1%，從而實現(xiàn)了較高的分析靈敏度，同時也具有極好的數(shù)據(jù)可重現(xiàn)性。
如下圖：
（A）935K 芯片技術(shù)重復(fù)相關(guān)性 R 2>0.99；
（B）935K 芯片和 850K 的交集探針間的相關(guān)性 R 2>0.99；
（C）935K 芯片數(shù)據(jù)與甲基化測序（100X 測序深度）的相關(guān)性 R 2>96%。
935K 芯片實測數(shù)據(jù)展示
嚴(yán)格按照 Illumina Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip（簡稱 935K）操作手冊完成 DNA 抽提、轉(zhuǎn)化、擴(kuò)增、雜交洗脫等，質(zhì)控結(jié)果說明雜交實驗過程穩(wěn)定、轉(zhuǎn)化率高、熒光信號和結(jié)合狀況良好，綜合說明實驗操作穩(wěn)定，可以進(jìn)一步做甲基化的數(shù)據(jù)分析。
